治结膜炎常用的眼药水有多种，具体需根据结膜炎类型选择。一般细菌性结膜炎可选用抗生素类眼药水，如左氧氟沙星滴眼液，它能有效抑制细菌生长繁殖，通常用药后几天内症状会有所改善。
细菌性结膜炎适用眼药水
左氧氟沙星滴眼液： 属于喹诺酮类抗生素，通过抑制细菌DNA旋转酶，阻碍细菌DNA复制，从而发挥杀菌作用，对多种引起细菌性结膜炎的常见细菌有效。妥布霉素滴眼液： 也是常用的抗生素眼药水，对革兰氏阳性菌及阴性菌有抗菌活性，可用于治疗敏感菌引起的细菌性结膜炎，使用时需注意按疗程规律用药。
病毒性结膜炎适用眼药水
阿昔洛韦滴眼液： 是抗病毒药物，能选择性抑制单纯疱疹病毒DNA多聚酶，阻止病毒DNA合成，从而发挥抗单纯疱疹病毒的作用，适用于病毒性结膜炎的治疗。更昔洛韦眼用凝胶： 同样针对病毒感染，可抑制病毒的复制过程，对病毒性结膜炎有一定疗效，使用时要遵医嘱正确使用。
过敏性结膜炎适用眼药水
色甘酸钠滴眼液： 能稳定肥大细胞细胞膜，阻止肥大细胞脱颗粒，从而抑制组胺、5-羟色胺、慢反应物质等过敏介质的释放，达到预防和治疗过敏性结膜炎的目的。富马酸依美斯汀滴眼液： 为组胺H1受体拮抗剂，可有效缓解过敏性结膜炎引起的眼部瘙痒等症状，用药时需注意避免接触瓶口，防止污染药液。
非感染性结膜炎的其他情况
对于一些非感染因素引起的结膜炎，如干眼症相关的结膜炎，可能会用到人工泪液类眼药水，像玻璃酸钠滴眼液，它能补充眼表水分，减轻因干眼导致的结膜炎症状，一般可根据眼部不适情况按需使用，每天使用次数可根据眼睛干燥程度调整。