双肾结石的治疗需根据结石大小、症状等综合判断，一般较小的结石可通过保守治疗，较大的可能需要手术等方式。通常对于直径小于0.6厘米的光滑结石，可先尝试保守治疗。
保守治疗方式
大量饮水： 每天饮水量要达到2000~3000毫升以上，这样能增加尿量，促进小结石随尿液排出。比如早上起床后先喝500毫升左右的水，白天分多次饮用，保证尿液持续稀释，降低结石形成和沉积的风险。饮食调整： 限制草酸含量高的食物，像菠菜、坚果、巧克力等要少吃；嘌呤高的食物，如动物内脏、海鲜也要控制摄入；同时要减少高钙、高盐食物的摄取。例如，每周吃菠菜的次数最好控制在1~2次，每次食用量别太多。
药物辅助治疗
排石药物： 可以使用一些促进结石排出的药物，如枸橼酸氢钾钠等，它能改变尿液酸碱度，使结石不易在体内形成，还能帮助已有的小结石排出。不过这类药物的使用要在医生指导下进行，因为不同病情适用情况不同。缓解疼痛药物： 如果结石引起疼痛，可使用非甾体抗炎药，如双氯芬酸钠等，能起到消炎止痛的作用，但不能自行随意长期大量服用，以免产生不良反应。
手术治疗情况
体外冲击波碎石： 对于直径在0.6~2厘米之间的结石，可考虑体外冲击波碎石。它是利用冲击波聚焦后击碎结石，让其随尿液排出。一般来说，经过1~2次体外冲击波碎石，大部分结石能被击碎排出，但可能会有少数人需要多次治疗。经皮肾镜取石术： 如果结石较大，直径超过2厘米，或者通过其他方法治疗效果不佳，可能需要做经皮肾镜取石术。医生会通过皮肤建立通道到达肾脏，然后用器械取出结石。这种手术创伤相对较小，但术后也需要一定时间恢复，大概需要住院3~7天左右。输尿管镜取石术： 当结石位于输尿管内，也可以采用输尿管镜取石术。医生通过尿道、输尿管插入镜体，找到结石后用激光等将结石击碎并取出。手术时间相对较短，术后恢复也比较快，但同样要遵循医生的术后护理建议。