胃肠神经官能症的治疗需综合多方面，一般可通过药物、心理及生活方式调整等综合处理。其中药物方面有多种选择，而心理干预也很关键，生活习惯的调整同样重要。
药物治疗常用药物
常用的药物有调节胃肠动力的药物，比如多潘立酮，它能促进胃肠蠕动，帮助改善腹胀等症状；还有调节内脏感觉的药物，像曲美布汀，可调节胃肠道的运动和感觉功能。但具体用药需在医生指导下进行，不同药物针对不同的症状表现来选用。
心理治疗的重要性
心理因素在胃肠神经官能症中起重要作用，认知行为疗法是常用的心理干预方式。通过认知行为疗法，患者可以改变对疾病的错误认知，调整不良的行为模式。例如，一些患者因过度关注胃肠不适而产生焦虑情绪，通过认知行为疗法能帮助患者正确看待自身的胃肠症状，缓解焦虑。另外，支持性心理治疗也不可忽视，家人和医生给予患者心理上的支持，让患者感受到关心和理解，有助于减轻患者的心理负担，对病情恢复有积极作用。
生活方式的调整要点
首先是饮食方面，要规律进食，定时定量，避免过饥过饱。同时，要避免食用刺激性食物，如辛辣、油腻、过冷过热的食物，这些食物容易刺激胃肠道，加重胃肠神经官能症的症状。一般建议每天三餐定时，每餐七八分饱即可。其次是作息要规律，保证充足的睡眠，良好的睡眠有助于调节身体的神经功能，对胃肠功能的恢复也有帮助。另外，适度运动也很重要，比如每天进行30分钟左右的散步等有氧运动，能促进胃肠蠕动，改善胃肠功能，但要注意运动强度不宜过大。