新生儿黄疸是新生儿时期常见的现象，约60%足月儿和80%早产儿会出现生理性黄疸。新生儿黄疸的原因主要有以下几方面：
生理性黄疸的原因
胆红素生成较多：新生儿每日生成的胆红素约为成人的2倍多。这是因为新生儿红细胞寿命短，且数量多，破坏后产生的胆红素相应增多。肝功能不成熟：新生儿肝细胞内尿苷二磷酸葡萄糖醛酸转移酶（UDPGT）含量低且活性不足，不能有效将未结合胆红素转变为结合胆红素，使得未结合胆红素在体内积聚，从而引发黄疸。一般足月儿生理性黄疸在出生后2-3天出现，4-5天达到高峰，5-7天消退，最迟不超过2周；早产儿则多于出生后3-5天出现，5-7天达高峰，7-9天消退，最长可延迟到3-4周。
病理性黄疸的原因
胆红素生成过多
红细胞增多症：常见于母亲和胎儿血型不合引起的宫内出血，或双胎输血、胎盘延迟剥离等情况，使红细胞数量过多，破坏后产生大量胆红素。同族免疫性溶血：如ABO血型不合或Rh血型不合等，母亲和胎儿血型不同，母亲的抗体通过胎盘进入胎儿体内，破坏胎儿红细胞，导致胆红素生成增加。感染：细菌、病毒等感染可导致新生儿出现败血症等，使红细胞破坏增多，胆红素产生过多。比如金黄色葡萄球菌、大肠杆菌等感染都可能引发这种情况。肠肝循环增加：先天性肠道闭锁、幽门肥厚、巨结肠等肠道疾病可导致胎便排出延迟，使胆红素重吸收增加；母乳喂养的新生儿还可能出现母乳性黄疸，其机制可能与母乳中的某些物质抑制了葡萄糖醛酸转移酶的活性，影响了胆红素的代谢有关，一般在出生后1-3个月内黄疸持续不退，但小儿一般情况良好。
肝脏胆红素代谢障碍
缺氧和感染：新生儿窒息、肺炎等缺氧及感染情况，可抑制肝细胞内UDPGT的活性，影响胆红素的结合。药物：某些药物如磺胺类、吲哚美辛等，可与胆红素竞争Y、Z蛋白的结合位点，干扰胆红素的正常代谢。
胆汁排泄障碍
新生儿肝炎：多由病毒引起的宫内感染所致，如乙型肝炎病毒、巨细胞病毒等，可导致肝细胞功能受损，胆红素代谢障碍。先天性胆道闭锁：多是由于胆道发育异常，导致胆道梗阻，胆汁排泄受阻，使得结合胆红素逆流入血，引发黄疸。一般在出生后2周左右出现黄疸并进行性加重，同时伴有陶土色大便。