肛门有水泡可能是由皮肤过敏、单纯疱疹、肛周脓肿等原因导致的，需到医院详细检查后针对病因治疗，不可盲目自行处理。
一、皮肤过敏：若自身是过敏体质，接触过敏原后，易引发局部变态反应，导致毛细血管扩张，血浆在皮肤下渗透积聚可形成水泡。可服用抗过敏药物如盐酸西替利嗪片、氯雷他定片等进行治疗。
1.盐酸西替利嗪片：可用于缓解过敏引起的相关症状。
2.氯雷他定片：对多种过敏反应有疗效。
二、单纯疱疹：通常是肛门处感染单纯疱疹病毒所致，会使肛门出现水泡。一般可在医生指导下服用抗病毒药物如阿昔洛韦、泛昔洛韦等进行医治。
1.阿昔洛韦：是常用的抗病毒药。
2.泛昔洛韦：对单纯疱疹病毒有抑制作用。
三、肛周脓肿：常导致局部皮肤出现较深水泡，还可能出现脓肿面积扩大或溃疡等情况。若自身症状严重，则需要采取切开引流手术治疗。
总之，当发现肛门有水泡时，应尽快就医明确原因，并遵医嘱选择合适的治疗方法。