肛门上长水泡可能由以下原因引起：
1.肛门湿疹：由多种内外因素引起的肛门周围皮肤湿疹样改变，可能会出现红斑、丘疹、水疱等，伴有瘙痒。可能与过敏、局部刺激、感染等有关。可外用糖皮质激素软膏，如糠酸莫米松乳膏；瘙痒明显者可口服抗组胺药物，如氯雷他定。
2.生殖器疱疹：由单纯疱疹病毒感染引起，主要通过性接触传播。肛门周围会出现红斑、簇集性小水疱，破溃后形成糜烂或溃疡，伴有疼痛。可口服抗病毒药物，如阿昔洛韦、伐昔洛韦；局部可涂抹抗病毒药膏，如阿昔洛韦乳膏。
3.外痔：肛缘皮下静脉丛形成的静脉团，在急性发作时，可表现为肛门部肿物、疼痛。有时也会出现水疱。可外用痔疮膏、栓剂，如马应龙麝香痔疮膏、肛泰栓等；如果症状严重，需要手术治疗。
4.其他：肛门周围的皮肤感染、接触性皮炎、性病等也可能导致肛门上长水泡。
如果出现肛门上长水泡的情况，建议及时就医，明确诊断后进行相应的治疗。同时，要注意保持肛门局部清洁，避免搔抓、摩擦，避免食用辛辣刺激性食物。如果是性传播疾病引起的，应避免性生活，以免传染给他人。