扁平疣主要是由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起的，其中约65%的扁平疣与HPV - 3型病毒有关。
病毒传播途径
直接接触传播： 比如与扁平疣患者直接握手等接触，就有可能被传染。如果皮肤有细微破损，病毒更容易入侵。间接接触传播： 使用扁平疣患者用过的毛巾、浴巾等个人物品，也可能感染病毒。因为病毒可以在这些物品上存活一段时间，如果健康人接触了被污染的物品，就有感染风险。
易患人群特点
免疫力低下者： 当人体免疫力较弱时，比如长期熬夜、过度劳累、患有慢性疾病等情况，身体抵御HPV的能力下降，就更容易感染扁平疣。像一些患有艾滋病的患者，由于免疫系统严重受损，感染扁平疣的几率会大大增加。青少年和儿童： 青少年和儿童的免疫系统相对还在发育中，比较脆弱，所以也是扁平疣的高发人群。尤其是一些在学校等集体环境中的儿童，由于密切接触，更容易相互传染。
皮肤破损因素影响
皮肤有微小破损时： 皮肤表面的微小破损为HPV的入侵提供了门户。比如皮肤被擦伤、划伤等，即使伤口很细微，病毒也能通过这些破损处进入皮肤细胞内，从而引发感染导致扁平疣。像经常从事户外劳动的人，皮肤容易有小的擦伤，相对来说感染扁平疣的风险可能会高一些。