扁平疣主要是由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起的，其中HPV - 3型是引起扁平疣的主要病原体。一般青少年更容易患上扁平疣，这与他们免疫系统相对不够成熟有关。
病毒感染途径：直接接触传播
人乳头瘤病毒可以通过直接接触患者的皮肤而感染。比如，与扁平疣患者共用毛巾、脸盆等个人物品时，就有可能被传染。另外，在公共浴室、游泳池等公共场所，皮肤直接接触到被病毒污染的物体表面，也存在感染风险。
自身皮肤破损因素：皮肤屏障受损易感染
当皮肤出现微小破损时，HPV更容易侵入皮肤细胞。比如，皮肤被抓伤、擦伤等，这时候病毒就有可乘之机。青少年在玩耍过程中，皮肤容易出现小的破损，所以相对更易感染扁平疣。而且，自身免疫力较低的时候，即使接触了病毒，也更难抵御，从而增加了患扁平疣的可能性。
免疫力状况影响：免疫力低下易发病
免疫力较差的人群，比如长期患有慢性疾病、过度劳累、营养不良的人，身体对HPV的清除能力减弱。青少年如果作息不规律、饮食不均衡，导致免疫力下降，就容易感染扁平疣。例如，有些青少年长期熬夜，睡眠不足，身体免疫力降低，就比作息规律的孩子更容易被HPV感染而患上扁平疣。