扁平疣主要是由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起的，尤其是HPV - 3型、HPV - 5型等亚型病毒。一般来说，人体皮肤黏膜有微小破损时，HPV就容易侵入并感染上皮细胞，进而导致细胞异常增殖，引发扁平疣。
病毒传播途径
直接接触传播： 比如与扁平疣患者直接接触，就有可能被传染。例如，和患者握手、共用毛巾等，都可能让病毒有可乘之机。间接接触传播： 通过接触被患者污染的物品，像共用文具、餐具等，也可能感染HPV从而患上扁平疣。
易患人群特点
免疫力低下者： 当人体免疫力较弱时，抵御HPV的能力下降，更容易感染扁平疣。比如长期熬夜、过度劳累、患有慢性疾病等导致免疫力降低的人，相对更易被HPV侵袭引发扁平疣。青少年群体： 青少年的皮肤比较娇嫩，而且免疫系统还在发育中，相对更容易感染HPV，所以扁平疣在青少年中的发病率相对较高。
皮肤破损相关因素
皮肤有微小破损： 皮肤如果出现擦伤、抓伤等微小破损，就为HPV的入侵打开了方便之门。比如孩子在玩耍时不小心划伤了皮肤，此时如果接触到含有HPV的物品或人群，就容易感染扁平疣。经常摩擦皮肤部位： 像手部、面部等经常受到摩擦的部位，皮肤屏障更容易受损，也就增加了感染扁平疣的风险。例如，经常用手搔抓面部的人，面部皮肤容易出现微小破损，进而增加感染HPV引发扁平疣的可能性。