肾结石的形成与多种因素相关，一般来说，尿液中某些物质浓度过高、尿液酸碱度异常以及尿路梗阻等都可能引发肾结石。比如，人体尿液中钙、草酸、尿酸等成分排出量增加，就容易形成结石。
代谢异常导致
尿液成分异常：当尿液中钙、草酸、尿酸、胱氨酸等物质含量过高时，就容易析出形成晶体，进而发展为结石。例如，正常饮食情况下，有些人尿液中钙的排泄量会高于常人，长期如此就增加了患肾结石的风险。尿酸代谢紊乱：体内尿酸生成过多或尿酸排泄减少，会使尿酸浓度升高，当尿液中尿酸过饱和时，就容易形成尿酸结石。有研究发现，痛风患者由于尿酸代谢异常，患尿酸结石的几率比普通人要高不少。
尿路梗阻因素
尿道狭窄或畸形：如果存在尿道狭窄、尿道瓣膜或者先天性尿道畸形等情况，会导致尿液排出不畅，尿液中的晶体物质就容易在局部积聚，从而形成结石。比如先天性尿道下裂的患者，就可能因为尿路梗阻增加肾结石的发病风险。前列腺增生：中老年男性中前列腺增生较为常见，增生的前列腺会压迫尿道，使尿液排出受阻，尿液滞留易促使肾结石形成。据统计，50岁以上患有前列腺增生的男性，患肾结石的概率相对较高。
饮食与生活习惯影响
饮水不足：每天饮水量少于1500毫升时，尿液会浓缩，尿液中晶体物质的浓度相对升高，容易形成结石。一般建议每天饮水量应保持在2000 - 3000毫升以上，以保证尿液稀释，减少结石形成风险。高草酸食物摄入过多：像菠菜、苋菜、巧克力、坚果等食物中草酸含量较高，如果长期大量食用，会使体内草酸摄入过多，经过代谢后尿液中草酸浓度升高，增加草酸钙结石形成的可能性。例如，经常大量吃菠菜的人，患草酸钙肾结石的几率会比饮食清淡的人高。高嘌呤食物摄入：动物内脏、海鲜、肉汤等食物嘌呤含量较高，嘌呤代谢的最终产物是尿酸，过多摄入高嘌呤食物会使尿酸生成增加，易形成尿酸结石。有数据显示，长期大量食用高嘌呤食物的人群，肾结石发病率比正常饮食人群高出2 - 3倍。