肾结石形成的原因较多，主要与代谢异常、局部因素、药物相关等有关。比如尿液中某些物质浓度过高，超过了其在尿液中的溶解度，就容易析出形成结石。一般来说，肾结石的形成涉及多种复杂因素相互作用。
代谢异常相关原因
尿液成分异常：
钙代谢异常：当尿钙排泄增多时，比如一些人肠道对钙的吸收增加，或者肾脏对钙的重吸收出现问题等，就可能导致尿液中钙的浓度升高。正常情况下尿液中钙、草酸、尿酸等物质需要维持在一定平衡范围，一旦钙过多，就容易与其他成分结合形成结石核心。据研究，约有60%的肾结石患者存在钙代谢异常的情况。草酸代谢异常：如果摄入过多富含草酸的食物，像菠菜、巧克力、坚果等，或者体内草酸产生过多，而肾脏排泄草酸功能出现障碍，都会使尿液中草酸含量升高。当草酸与钙结合时，就容易形成草酸钙结石。例如，长期大量食用菠菜的人群，患草酸钙结石的风险相对较高。
尿液酸碱度异常：
尿液酸碱度对结石形成有影响。如果尿液偏酸性，容易形成尿酸结石和胱氨酸结石；如果尿液偏碱性，则容易形成磷酸镁铵结石和磷酸钙结石。比如痛风患者由于尿酸代谢紊乱，尿液呈酸性，容易引发尿酸结石。
局部因素相关原因
尿路梗阻：
当尿路存在狭窄、畸形等情况时，会导致尿液排出不畅。尿液在肾脏内停留时间过长，其中的一些成分就容易沉淀、结晶，逐渐形成结石。像先天性肾盂输尿管连接部狭窄的患者，就比正常人更容易发生肾结石。而且尿路梗阻还会加重结石的形成，形成恶性循环。
感染因素：
尿路感染时，细菌、脓块等会作为核心，使尿液中的矿物质围绕其沉积形成结石。例如，变形杆菌等细菌能分解尿素产生氨，使尿液碱化，促使磷酸镁铵和磷酸钙沉积形成结石。
药物相关原因
某些药物导致：
一些药物在体内代谢后，其成分可能会促进结石形成。比如长期服用维生素C，在体内代谢后可能使尿液中草酸含量增加；还有磺胺类药物，其代谢产物容易在尿液中析出形成结晶，进而发展为结石。