心脏官能症的药物治疗需根据不同症状来选择。一般来说，对于伴有焦虑、抑郁情绪的患者，常用的药物有抗焦虑抑郁药。比如选择性5 - 羟色胺再摄取抑制剂，像帕罗西汀等，有研究显示约60% - 70%的心脏官能症患者在规范使用这类药物后，情绪和相关心脏不适症状能得到改善。
抗焦虑抑郁类药物
选择性5 - 羟色胺再摄取抑制剂： 像帕罗西汀，它能选择性地抑制突触前膜对5 - 羟色胺的再摄取，增加突触间隙5 - 羟色胺浓度，从而改善焦虑、抑郁情绪，对心脏官能症中因情绪因素导致的不适有一定缓解作用。5 - 羟色胺和去甲肾上腺素再摄取抑制剂： 例如文拉法辛，它能同时抑制5 - 羟色胺和去甲肾上腺素的再摄取，对于既有抑郁又有焦虑症状的心脏官能症患者较为适用，能从多方面调节神经递质，改善相关症状。
改善心悸等症状的药物
β受体阻滞剂： 比如普萘洛尔，它可以阻断心脏的β受体，减慢心率，降低心肌收缩力，从而缓解心悸等症状。不过，哮喘患者禁用，因为它可能会诱发哮喘发作。镇静安神类药物： 像艾司唑仑，对于存在睡眠障碍的心脏官能症患者有帮助，能帮助入睡，改善睡眠质量，进而间接缓解因睡眠不佳引发的心脏不适等症状，但这类药物长期使用可能会产生依赖性，需在医生指导下谨慎使用。
特殊人群用药注意
老年人： 老年人使用抗焦虑抑郁药时要特别谨慎，起始剂量宜小，并且要密切监测药物不良反应，因为老年人对药物的代谢和耐受能力有所下降。儿童： 儿童一般不首选抗焦虑抑郁药来治疗心脏官能症，更多是通过心理疏导等非药物方式来干预，因为儿童处于生长发育阶段，药物对其影响尚需更多研究明确。同时，在使用任何药物治疗心脏官能症时，都需要在医生的严格评估和指导下进行，不能自行随意用药。