心脏官能症的治疗药物需根据具体症状来选择，一般常用调节神经功能的药物。比如对于有焦虑抑郁情绪的患者，可能会用到抗焦虑抑郁药，像选择性5 - 羟色胺再摄取抑制剂等。不过具体用药要因人而异，并没有绝对说哪种药最有效，而是要根据患者个体情况来定。
常用调节神经的药物
谷维素： 它是从米糠油中提取的一种维生素类药物，能调节植物神经功能，改善精神神经失调症状，对心脏官能症有一定辅助调节作用，一般没有明显的毒副作用。维生素B1： 参与体内辅酶的形成，能维持神经、心脏及消化系统正常功能，缺乏时可能会影响神经功能，补充维生素B1有助于改善心脏官能症相关的神经功能紊乱情况。
抗焦虑抑郁药物的应用
选择性5 - 羟色胺再摄取抑制剂： 像帕罗西汀等，这类药物可以通过调节大脑中5 - 羟色胺的水平来改善焦虑抑郁情绪，从而缓解心脏官能症伴随的焦虑等症状，但使用时需要在医生指导下根据患者具体的焦虑抑郁程度来选用。苯二氮䓬类药物： 比如阿普唑仑，有抗焦虑、镇静作用，可用于缓解心脏官能症患者的焦虑紧张情绪，但这类药物长期使用可能会有成瘾性，所以一般短期使用或者在必要时使用。
特殊人群用药注意
老年人： 老年人使用调节神经药物时要更加谨慎，因为老年人肝肾功能可能有所减退，药物代谢能力下降，需要密切观察药物不良反应，从小剂量开始逐渐调整剂量。儿童： 儿童一般不首选抗焦虑抑郁药物来治疗心脏官能症，通常以非药物干预为主，如心理疏导等，如果确实需要用药，必须在医生严格评估下，选择对儿童影响较小的药物，且要密切监测儿童的反应。孕妇： 孕妇使用药物要非常慎重，若心脏官能症孕妇需要用药，应权衡药物对胎儿的影响和病情本身对孕妇的影响，优先选择对胎儿影响小的药物，并且在医生全程监护下使用。