怀孕通常即指妊娠，小肚子通常就是指小腹。妊娠两个月时小腹隐隐作痛，可能由以下原因导致。
一、子宫增大：在妊娠两个月时，因体内激素变化较大，且胚胎不断生长，子宫会随之增大。子宫增大后会牵拉周围韧带，从而引起小腹部疼痛。这属于正常生理现象，通常无需特殊处理。
二、先兆流产：妊娠两个月处于妊娠早期，胚胎尚不稳定，若情绪过激或受到外界物理刺激，容易引发先兆流产。其可导致阴道出血，多为少量出血或褐色分泌物，同时伴有小腹疼痛。此时可遵医嘱使用保胎无忧片、保胎灵胶囊等药物来缓解症状。
三、异位妊娠：如果表现为小腹部一侧疼痛，并伴有不规则阴道出血，可能是发生了异位妊娠。可在医生指导下服用米非司酮片、甲氨蝶呤片等药物进行治疗。
此外，还可能存在其他原因，比如葡萄胎、子宫肌瘤、盆腔癌等。若不适症状严重，应及时前往医院就诊。
总结：妊娠两个月小腹隐痛可能是子宫增大等多种原因造成，要根据具体情况判断并采取相应措施，严重时需及时就医。