急性尿道炎主要是由病原体感染引起的，常见的病原体有大肠杆菌、支原体、衣原体等，大约50%的急性尿道炎是由沙眼衣原体和解脲支原体导致的。
病原体感染途径
经性传播感染： 这是急性尿道炎的主要原因之一。比如沙眼衣原体、解脲支原体等病原体，可通过无保护的性行为在男女之间传播。在不洁性行为后，病原体容易侵入尿道，引发炎症反应。尿道损伤： 尿道器械检查等操作可能会引起尿道黏膜擦伤，破坏尿道的防御屏障，使得细菌等病原体容易入侵。例如，进行导尿等操作时，如果操作不规范，就可能导致尿道损伤进而引发急性尿道炎。尿道梗阻： 像包皮口狭窄、尿道外口狭窄、尿道结石等情况，会导致尿液排出不畅，尿液在尿道内积聚，为病原体的生长繁殖提供了有利环境。长期的尿液潴留还会使尿道黏膜受到尿液的刺激，抵抗力下降，容易发生感染引发急性尿道炎。
局部卫生状况不佳
如果不注意尿道局部的清洁卫生，会增加感染的风险。比如女性外阴部的细菌容易蔓延至尿道，如果不及时清洗，就可能引发急性尿道炎。尤其是在月经期间，女性更要注意外阴的清洁，否则细菌滋生更容易导致尿道感染。另外，男性如果不经常清洗阴茎包皮部位，包皮垢积聚也可能引起尿道感染，从而诱发急性尿道炎。
机体抵抗力下降
当人体抵抗力下降时，比如患有糖尿病等慢性疾病，或者长期使用免疫抑制剂等，身体的免疫防御功能减弱，无法有效抵御病原体的入侵，就容易发生急性尿道炎。例如，糖尿病患者由于血糖控制不佳，机体的免疫功能受到影响，尿道更容易被细菌等感染而引发急性尿道炎。