生化流产是指精卵结合后，没有成功在子宫着床的妊娠。据统计，生化流产在早期妊娠丢失中占比较高。
染色体异常因素
胚胎染色体异常： 这是导致生化流产最常见的原因之一。大约50% - 60%的生化流产是由于胚胎本身染色体数目或结构异常引起的。比如，染色体数目异常可能是多了一条染色体或者少了一条染色体等情况，这种异常会使得胚胎无法正常发育并着床。父母染色体问题： 若父母双方有一方存在染色体平衡易位等问题，也可能传递给胚胎，影响胚胎正常着床，增加生化流产的发生风险。例如父亲或母亲的染色体结构发生改变，就可能导致遗传给胚胎的染色体出现异常情况。
子宫因素影响
子宫解剖异常： 像子宫畸形，如纵隔子宫、双角子宫等，会影响子宫的内环境，使得胚胎着床困难。纵隔子宫是子宫腔内有纵隔将子宫分成两部分，这会干扰胚胎的正常着床位置和着床后的发育。子宫内膜问题： 子宫内膜厚度不合适或者容受性差也会导致生化流产。一般来说，子宫内膜厚度在8 - 12毫米比较适合胚胎着床，如果子宫内膜过薄（小于8毫米）或者过厚（大于12毫米），都可能影响着床。另外，子宫内膜炎等疾病会改变子宫内膜的质地和环境，不利于胚胎着床。
内分泌因素作用
黄体功能不全： 黄体分泌的孕酮对于维持妊娠至关重要。如果黄体功能不全，孕酮分泌不足，就无法为胚胎着床和早期发育提供良好的内分泌环境。一般通过检测孕酮水平等可以发现黄体功能不全的情况。甲状腺功能异常： 甲状腺功能减退或亢进都会影响生化妊娠。甲状腺激素对胚胎的生长发育有重要调节作用，甲状腺功能减退时，体内甲状腺激素水平降低，会影响胚胎的着床和发育；甲状腺功能亢进时，过高的甲状腺激素水平也会干扰妊娠的正常进程，增加生化流产的发生几率。
免疫因素干扰
自身免疫异常： 例如存在抗磷脂抗体综合征等自身免疫性疾病时，体内的自身抗体可能会攻击胎盘组织，影响胚胎的血供，导致胚胎无法正常着床和发育。抗磷脂抗体可以破坏胎盘的血管，使得胎盘供血不足，进而引发生化流产。同种免疫异常： 母体对胚胎的免疫排斥反应过强也可能导致生化流产。母体的免疫系统不能正确识别胚胎为自身组织，从而发动免疫攻击，使得胚胎着床失败。