早上起床肩膀特别酸痛可能与以下原因有关：
1.夜间睡姿不良：如果睡觉时长期压迫肩膀，或使用过高的枕头，可能导致肩膀血液循环不畅，引起酸痛。
2.肩部肌肉劳损：长期从事重体力劳动、伏案工作或进行剧烈运动，可能导致肩部肌肉劳损，从而出现酸痛症状。
3.肩周炎：肩周炎又称“五十肩”，好发于50岁左右人群，主要表现为肩部疼痛和活动受限。其病因尚不明确，可能与肩部软组织退行性病变、肩部损伤、肩部感受风寒等因素有关。
4.颈椎病：颈椎间盘突出、颈椎管狭窄等颈椎病可能压迫神经根，导致肩部放射性疼痛和酸痛。
5.其他：心脏疾病、肺部疾病等也可能引起肩部牵涉痛。
针对早上起床肩膀特别酸痛的情况，可以采取以下措施：
1.调整睡姿：选择合适的枕头，保证睡眠时肩膀得到充分支撑，避免长时间压迫。
2.注意保暖：肩部避免受寒，尤其是在季节交替时。
3.适当休息：避免过度劳累，尤其是长时间保持同一姿势。
4.物理治疗：可以通过热敷、按摩、针灸等方法缓解疼痛。
5.药物治疗：如果疼痛严重，可以在医生的指导下使用非甾体类抗炎药，如布洛芬、阿司匹林等。
6.就医检查：如果疼痛持续不缓解或伴有其他症状，如上肢麻木、无力等，应及时就医，进行相关检查，以明确病因，并采取相应的治疗措施。
需要注意的是，以上内容仅供参考，如果症状持续不缓解或加重，建议及时就医，以便明确病因，进行针对性治疗。