大便时肛门痛的原因可能有以下几点：
1.肛裂：肛管皮肤全层纵行裂开并形成感染性溃疡，是一种常见的肛管疾病。典型表现为肛门疼痛、便秘和出血。肛门视诊可发现肛裂“三联征”，即肛裂、前哨痔和肛乳头肥大。
2.痔疮：内痔或混合痔脱出、嵌顿，可引起肛门括约肌痉挛，导致疼痛。
3.肛管或直肠损伤：肛管或直肠因外伤或手术而导致的裂伤，可引起疼痛。
4.肛门直肠周围脓肿：是肛管、直肠周围软组织内或其周围间隙内发生的急性化脓性感染，并形成脓肿。脓肿破溃或切开引流后可形成肛瘘。
5.肛乳头炎：多因肛裂、肛瘘等疾病继发感染所致，除肛门痛外，还伴有肛门瘙痒、异物感等症状。
6.外痔：炎性外痔、血栓性外痔、结缔组织性外痔等外痔，也可导致肛门疼痛。
7.其他：肛管直肠癌、溃疡性结肠炎、克隆恩病等疾病，也可引起肛门疼痛。
如果出现大便时肛门痛的症状，建议及时就医，明确病因，并在医生的指导下进行治疗。同时，要注意保持肛门局部清洁，避免食用辛辣刺激性食物，养成良好的排便习惯。