扁平疣是由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起的皮肤良性赘生物，治疗方法有多种，其中药物治疗是常见方式之一。常用的药物有维A酸类药物，如维A酸乳膏，它可以调节表皮细胞的分化，对扁平疣有一定的治疗作用，但一般需要连续使用数周才能见效。
物理治疗方法
冷冻治疗： 利用低温使疣体坏死脱落。通常治疗后1 - 2周疣体可能结痂脱落，不过可能需要多次治疗才能完全去除扁平疣。治疗时局部会有轻度疼痛，治疗后要注意保持创面清洁，避免感染。激光治疗： 用激光的高能量烧灼疣体，使其碳化脱落。激光治疗相对快捷，但术后局部会有创面，需要注意护理，防止感染，一般1 - 2周创面可愈合。
免疫调节治疗
干扰素： 具有抗病毒和免疫调节作用。可以通过局部注射或外用干扰素制剂来治疗扁平疣。局部注射干扰素可能会有局部疼痛等不适，外用干扰素相对较为方便，但一般起效较慢，可能需要连续使用数周甚至数月。对于免疫功能低下的患者，使用干扰素调节免疫可能会有一定帮助。
中医中药治疗
内服中药： 一些中药方剂具有清热解毒、活血化瘀等作用来治疗扁平疣。例如，有些方剂会用到板蓝根、大青叶、马齿苋等中药，但具体的方剂需要根据患者的个体情况由医生辩证开具，不同患者可能配方不同。外用中药： 像用马齿苋、板蓝根、生薏米等中药煎水外洗，有一定的抗病毒、改善局部症状的作用。外洗时要注意保持药液温度适宜，避免烫伤皮肤。