肾盂肾炎主要是由细菌感染引起的，其中最常见的致病菌是大肠埃希菌，约占60%~80%。细菌可通过上行感染、血行感染等途径引发肾盂肾炎。
上行感染是常见途径
尿道细菌逆行： 当尿道口周围存在细菌时，比如女性尿道短且直，细菌更容易从尿道上行进入膀胱，然后再沿着输尿管蔓延至肾盂，从而引发肾盂肾炎。例如，女性在性生活后，就比较容易出现这种上行感染的情况。膀胱输尿管反流： 某些情况下，膀胱内的尿液会反流回输尿管甚至肾盂，若尿液中带有细菌，就会增加肾盂感染的风险。比如先天性输尿管膀胱连接部异常的患者，更容易发生膀胱输尿管反流。
血行感染也可致病
细菌通过血液传播： 身体其他部位有感染病灶时，细菌可通过血液循环到达肾脏引发肾盂肾炎。像皮肤感染、扁桃体炎等，细菌可能随着血流到达肾脏。比如金黄色葡萄球菌菌血症时，细菌就有可能转移到肾脏引起肾盂肾炎。免疫力低下时易发生： 当人体免疫力较低时，比如患有糖尿病、艾滋病等疾病，或者长期使用免疫抑制剂的人群，血行感染导致肾盂肾炎的几率会增加。因为免疫力低下时，身体清除细菌的能力减弱，细菌更容易在肾脏定植。
易感人群需多注意
女性群体： 女性由于生理结构的特点，尿道短而宽，距离肛门较近，更容易受到细菌感染，所以女性患肾盂肾炎的几率比男性高。比如青春期女性、已婚女性等，都是肾盂肾炎的高发人群。尿路有梗阻的人： 如患有尿路结石、前列腺增生等疾病的人，尿液排出受阻，细菌容易在尿路繁殖，从而增加肾盂肾炎的发病风险。例如尿路结石患者，结石会阻碍尿液的正常流动，使细菌容易在局部滋生。泌尿系统结构异常者： 像先天性输尿管畸形等泌尿系统结构异常的人，尿液的正常流通受到影响，也容易引发肾盂肾炎。比如先天性输尿管狭窄的患者，尿液排出不畅，容易发生感染。