肛门里面疼痛可能由多种原因引起。比如，痔疮是常见原因之一，其中内痔脱出嵌顿或外痔血栓形成时，常常会导致肛门里面疼痛，尤其在排便后或行走时疼痛可能加重。
痔疮导致的肛门里面疼痛
内痔脱出嵌顿： 内痔发展到一定程度，排便时易脱出肛门外，如果不能及时回纳，就会肿胀、疼痛，一般脱出时间较长时疼痛会更明显。外痔血栓形成： 肛门周围皮下静脉丛形成血栓，会突然出现肛门部剧烈疼痛，触摸时能感觉到硬结。
肛周脓肿引发的肛门里面疼痛
肛腺感染引起： 肛腺受到细菌感染后，炎症会向周围组织蔓延，形成肛周脓肿，患者会感到肛门里面持续的胀痛，而且随着脓肿的增大，疼痛会逐渐加重，还可能伴有发热等全身症状。位置较深的脓肿： 深部的肛周脓肿疼痛可能不太容易察觉，但会有明显的坠胀感，同时伴有肛门周围红肿等表现。
肛裂造成的肛门里面疼痛
便秘引发： 长期便秘，大便干结粗硬，排便时容易撑裂肛管皮肤，导致肛裂，排便时会出现肛门里面刀割样或烧灼样疼痛，排便后还会有一段时间的疼痛缓解期，之后又会再次疼痛。反复肛裂： 陈旧性肛裂由于裂口反复不愈合，肛门里面疼痛会比较顽固，还可能伴有便血等症状。
肠道炎症导致的肛门里面疼痛
溃疡性结肠炎： 这是一种慢性非特异性肠道炎症性疾病，累及直肠时，患者会感觉肛门里面有隐痛、坠胀感，还可能伴有腹泻、黏液脓血便等症状。克罗恩病： 病变累及肛门直肠时，也会出现肛门里面疼痛，同时可能有腹痛、腹泻、体重下降等表现。