怀孕40多天可以做药物流产，但需要注意以下几点：
1.药流时间：怀孕49天内且经B超确诊为宫内妊娠的女性，可进行药流。
2.药流药物：药流常用的药物是米非司酮和米索前列醇。米非司酮可使子宫蜕膜变性坏死、宫颈软化，而米索前列醇能促进子宫收缩，使胚胎排出。
3.药流成功率：药流的成功率为90%左右，如果药流不全，需要进行清宫手术。
4.药流副作用：药流可能会出现恶心、呕吐、腹痛、腹泻等胃肠道反应，还可能会导致出血时间长、出血量多等。
5.药流禁忌症：患有肾上腺疾病、糖尿病、心脏病等疾病的患者，以及带宫内节育器、妊娠和年龄超过35岁的女性，都不宜进行药流。
6.药流注意事项：药流后需要注意休息，避免劳累，加强营养，注意个人卫生，保持外阴清洁，药流后1周需要复查B超，了解宫腔内有无残留。
总之，药流有一定的风险，需要在医生的指导下进行。如果怀孕40多天，建议及时就医，根据个人情况选择合适的流产方式。