结肠炎的治疗药物需根据具体类型来选择，比如对于轻中度溃疡性结肠炎，常用氨基水杨酸制剂，像柳氮磺吡啶，一般需要连续服用数周甚至数月来控制炎症。
氨基水杨酸制剂类药物
美沙拉嗪：有口服剂型也有灌肠剂，口服美沙拉嗪能在肠道局部发挥作用，抑制炎症反应；灌肠用的美沙拉嗪可以直接作用于直肠和乙状结肠部位的炎症黏膜，缓解局部的充血、水肿等症状。奥沙拉嗪：也是氨基水杨酸类药物，通过在肠道内分解为5-氨基水杨酸来发挥抗炎作用，适用于轻中度的溃疡性结肠炎患者。
糖皮质激素类药物
泼尼松：对于氨基水杨酸制剂疗效不佳的中度及重度结肠炎患者可使用，能快速减轻炎症反应，但长期使用可能会有较多副作用，比如骨质疏松、血糖升高等，通常在病情得到控制后会逐渐减量。氢化可的松：可用于病情较重的结肠炎急性发作期，一般通过静脉给药的方式，能迅速缓解严重的炎症症状，但同样需注意长期使用的不良反应。
免疫抑制剂类药物
硫唑嘌呤：多用于对糖皮质激素治疗效果不佳或依赖的结肠炎患者，它可以抑制免疫系统的过度反应，起到调节免疫、控制炎症的作用，但起效相对较慢，可能需要数周甚至数月才能看到明显效果，而且使用过程中要密切监测血常规等指标，因为可能会引起白细胞减少等不良反应。巯嘌呤：作用机制与硫唑嘌呤类似，也可用于结肠炎的治疗，尤其适用于一些对其他药物反应不敏感的患者，但也需要关注其可能带来的血液系统等方面的副作用。
生物制剂类药物
英夫利西单抗：对于重度的、对传统治疗药物无效的结肠炎患者可以考虑使用，它是一种靶向肿瘤坏死因子的生物制剂，能特异性地结合肿瘤坏死因子，阻断其介导的炎症反应，但这类药物价格相对较高，而且使用前需要进行严格的评估，排除感染等禁忌证。