治疗直肠炎常用的药物有氨基水杨酸制剂、糖皮质激素、免疫抑制剂等。比如氨基水杨酸制剂中的柳氮磺吡啶，是治疗轻、中度直肠炎的常用药物。
氨基水杨酸制剂类药物
美沙拉嗪： 有口服剂型也有栓剂。栓剂可直接作用于直肠部位，能有效缓解直肠炎引起的炎症、腹泻等症状。一般来说，对于轻中度的直肠炎，可选用美沙拉嗪栓剂局部用药。柳氮磺吡啶： 是传统的氨基水杨酸制剂，口服后到达结肠部位，被肠道细菌分解为磺胺吡啶和5-氨基水杨酸，5-氨基水杨酸可抑制前列腺素合成，从而减轻炎症反应，对直肠炎有一定治疗作用，但部分患者可能会出现恶心、呕吐等胃肠道不适。
糖皮质激素类药物
氢化可的松灌肠剂： 对于氨基水杨酸制剂疗效不佳的中度、重度直肠炎患者，可使用氢化可的松灌肠剂。通过灌肠的方式，药物直接作用于直肠炎症部位，快速减轻炎症水肿等症状。不过长期使用可能会有一些副作用，如导致肠道菌群失调等。布地奈德混悬液灌肠： 布地奈德是一种局部作用较强的糖皮质激素，通过灌肠进入直肠部位，能有效抗炎，且全身副作用相对较小，适用于轻中度直肠炎患者，尤其是那些对氨基水杨酸制剂反应不佳的情况。
免疫抑制剂类药物
硫唑嘌呤： 适用于对糖皮质激素治疗效果不佳或有激素依赖的直肠炎患者。它通过抑制免疫反应来发挥作用，但起效相对较慢，一般需要数周甚至数月才能看到明显效果，而且可能会有骨髓抑制等不良反应，用药期间需要定期监测血常规等指标。巯嘌呤： 与硫唑嘌呤作用机制类似，也可用于直肠炎的治疗，尤其适用于一些病情较为顽固的患者，但同样存在可能导致骨髓抑制等风险，使用时需谨慎。