地图舌的病因目前尚未完全明确，可能与多种因素有关。一般认为，遗传因素可能起到一定作用，有研究显示约有10% - 30%的地图舌患者有家族史。
遗传因素影响
家族遗传倾向： 研究发现，如果家族中有亲属患有地图舌，那么其他家庭成员患地图舌的概率相对较高。比如在一些有遗传背景的家族中，多个直系亲属可能先后出现地图舌的症状表现。
免疫因素相关
免疫功能波动： 当人体免疫功能发生变化时，可能引发地图舌。例如，在儿童免疫系统发育不完善阶段，或者成年人在免疫力低下的时候，如长期疲劳、精神压力大等情况，容易出现免疫平衡失调，进而可能导致地图舌的发生。像长期熬夜的人，身体免疫调节受到影响，就更易受到地图舌的“青睐”。
营养因素关联
维生素与微量元素缺乏： 缺乏维生素B族以及锌、铁等微量元素可能和地图舌有关。比如维生素B2缺乏时，会影响黏膜的正常代谢；锌元素对于维持上皮组织的正常结构和功能很重要，缺锌时可能导致口腔黏膜出现异常，引发地图舌。有调查发现，饮食不均衡、挑食的人群，更容易出现维生素和微量元素缺乏的情况，从而增加地图舌的发病风险。
其他因素影响
口腔局部刺激： 口腔内的不良刺激也可能诱发地图舌。例如口腔内有龋齿、牙结石等，长期刺激口腔黏膜，可能干扰口腔黏膜的正常状态，促使地图舌的形成。另外，口腔内的一些不良修复体，如不合适的假牙等，反复摩擦口腔黏膜，也可能成为地图舌的诱发因素之一。