胃神经官能症的治疗需综合多方面，一般可通过药物、心理等方式干预。治疗时需遵循个体化原则。
药物辅助缓解症状
调节胃肠动力药物： 常用的有多潘立酮，它能促进胃肠蠕动，改善腹胀、早饱等症状。还有莫沙必利，也可增强胃肠道动力，帮助消化。调节内脏感觉药物： 如曲美布汀，能调节胃肠道平滑肌收缩，改善胃肠功能紊乱引起的不适。
心理治疗很关键
认知行为疗法： 患者要认识到自身的心理状态与胃肠症状的关联，通过改变不良的认知和行为模式来缓解症状。一般建议每周进行1 - 2次，每次约50 - 60分钟的认知行为疗法干预。放松训练： 例如深呼吸放松，患者找个舒适的位置坐下或躺下，慢慢地吸气，让腹部鼓起，然后缓缓呼气，每次练习10 - 15分钟，每天可进行2 - 3次。渐进性肌肉松弛也是常用方法，依次紧绷和放松不同部位的肌肉，缓解身体的紧张感，对改善胃神经官能症有帮助。
生活方式调整不可少
规律作息： 保证每天有7 - 8小时的充足睡眠，按时上床睡觉和起床，让身体的生物钟保持稳定，有利于胃肠功能的调节。合理饮食： 定时定量进餐，避免过饥过饱。尽量少吃辛辣、油腻、刺激性食物，如辣椒、油炸食品等。多吃易消化的食物，像米粥、面条等。同时，要减少咖啡、浓茶的摄入，因为它们可能会刺激胃肠道，加重不适。