胃神经官能症的治疗需要综合多方面来进行，一般可通过药物、心理以及生活方式调整等方法来改善。通常可以采用心理治疗配合适当药物辅助的方式。
心理治疗很关键
认知行为疗法： 通过帮助患者认识和改变不良的思维方式与行为习惯，来缓解胃神经官能症症状。比如让患者了解自身情绪与胃部不适的关联，学会用正确的方式应对压力和情绪。一般需要持续数周甚至数月的治疗过程。放松训练： 像深呼吸放松法，患者每天可以花10 - 15分钟进行深呼吸，慢慢地吸气，让腹部膨胀，然后缓缓呼气，重复进行。渐进性肌肉放松也是常用方法，依次紧张和放松身体各部位肌肉，帮助身心放松，减轻神经紧张对胃部的影响。
药物辅助治疗
调节胃肠动力药物： 多潘立酮可以促进胃肠蠕动，改善腹胀、早饱等症状。它能增强胃蠕动，加速胃排空，一般可在饭前半小时左右服用，但具体要遵医嘱。莫沙必利也是常用的促胃肠动力药，同样能促进胃肠道蠕动，缓解消化不良等相关症状。调节神经的药物： 谷维素可以调节植物神经功能，对胃神经官能症引起的植物神经功能紊乱有一定调节作用。一般每次可以服用10 - 20毫克，一天3次。维生素B1也有营养神经的作用，有助于改善神经功能状态，通常可以每日服用3次，每次10毫克左右。
生活方式的调整
饮食规律： 每天要定时进餐，尽量保持一日三餐规律，每餐食量要适中，避免过饥过饱。例如早餐可以在7 - 8点，午餐在11 - 12点，晚餐在18 - 19点左右。同时要避免食用刺激性食物，如辛辣的辣椒、过酸的醋等，以及过冷过热的食物，这些都可能刺激胃部，加重症状。适度运动： 每天进行适量的运动，比如散步，每次可以散步30分钟左右，每周可以进行3 - 5次。运动可以促进胃肠蠕动，帮助消化，还能缓解压力，改善身心状态，但要注意运动强度不宜过大，避免过度劳累。