通常情况下，跑步之后小腿肌肉疼痛的原因包括乳酸堆积、软组织损伤、筋膜炎等，患者可在医生指导下对症治疗。具体如下：
一、乳酸堆积：大量运动后可能导致小腿乳酸堆积，从而出现酸胀、疼痛等症状。这是正常现象。因为当人体进行剧烈活动时，肌肉会通过无氧代谢产生能量，在此过程中就会产生乳酸。当乳酸产生过多且不能及时代谢时，就会堆积在肌肉中引起疼痛。对于这种情况，患者可采取局部热敷的方式，这能松弛肌肉，促进血液循环，有助于缓解疼痛。
二、软组织损伤：在跑步过程中，如果动作幅度较大或进行剧烈运动，可能会引发软组织损伤，进而出现肿胀、疼痛、出血等表现。此时，患者可在医生指导下口服相关药物进行治疗，如布洛芬缓释胶囊可缓解疼痛和炎症；对乙酰氨基酚片具有解热镇痛作用；萘普生片也能发挥抗炎、止痛功效。
三、筋膜炎：筋膜炎指的是筋膜发生病理性改变，从而引起机体肌肉筋膜的多种不适症状，常见的有疼痛、肌紧张、肌无力等。对于由筋膜炎导致的跑步后小腿肌肉疼痛，患者可以遵医嘱使用一些药物进行治疗，比如双氯芬酸二乙胺乳胶剂可缓解局部疼痛；美洛昔康分散片有抗炎止痛作用；阿莫西林胶囊可起到抗菌消炎的效果。
总之，跑步后小腿肌肉疼痛可能是多种原因引起的，要根据具体情况选择合适的应对方法。如果疼痛持续不缓解或伴有其他严重症状，应及时就医。