小腿里面隐隐作痛可能由多种原因引起。比如运动相关的情况，若长时间运动或运动方式不当，可能导致小腿肌肉劳损，这种情况较为常见，约有30% - 40%的人在过度运动后会出现小腿隐隐作痛的情况。
一、肌肉骨骼方面的原因
1. 肌肉拉伤： 运动过程中突然的拉伸可能造成小腿肌肉拉伤，比如跑步时步伐过大或突然变向。轻度拉伤时，小腿会有隐隐作痛的感觉，还可能伴有局部的轻度肿胀。一般在拉伤后的1 - 2天内症状可能会有所表现。2. 筋膜炎： 小腿筋膜发生炎症也会引起隐隐作痛。长期站立、行走或者受到寒冷刺激等都可能诱发筋膜炎。例如一些职业需要长时间站立的人群，像售货员等，就比较容易出现小腿筋膜炎，表现为小腿部位的隐痛，在早晨起床或长时间不活动后开始活动时疼痛可能会更明显，活动一段时间后症状会有所缓解，但长时间活动又会加重。
二、血管方面的原因
1. 下肢静脉曲张： 多见于长期站立工作的人，如教师、交警等。下肢静脉回流不畅，静脉瓣功能出现问题，导致血液淤积在小腿静脉中，就会引起小腿隐隐作痛，还可能伴有小腿皮肤色素沉着、青筋凸起等表现。一般病情较轻时，疼痛不剧烈，呈隐隐作痛的感觉。2. 动脉供血不足： 比如动脉硬化等疾病，会影响小腿的动脉血液供应。当腿部活动时，需要更多血液供应，但动脉供血不足无法满足，就会出现小腿隐隐作痛的情况，这种疼痛在行走一段距离后会更加明显，休息后可缓解，医学上称为间歇性跛行。
三、神经方面的原因
1. 腰椎间盘突出症： 突出的椎间盘压迫神经根，可能会引起小腿放射性的隐隐作痛。除了小腿痛，还可能伴有腰部的不适，疼痛可能会从腰部放射到臀部、大腿后侧再到小腿部位。一般在久坐、弯腰等动作后症状可能会加重。2. 坐骨神经痛： 坐骨神经受到压迫或刺激时，也会导致小腿隐隐作痛。例如梨状肌综合征，梨状肌紧张或痉挛压迫坐骨神经，就会引起小腿的疼痛，疼痛可呈放射性，从臀部向小腿后侧延伸。