干燥综合症的病因目前尚未完全明确，但研究发现可能与以下几方面因素有关。据相关研究表明，遗传因素在干燥综合症的发病中起到一定作用，有遗传背景的人群患病风险相对较高。
遗传因素方面
基因易感性： 一些特定的基因位点与干燥综合症的发病相关。比如人类白细胞抗原（HLA）基因，某些HLA基因亚型的携带人群更容易患上干燥综合症。研究发现，HLA - DR3、HLA - DR4等基因亚型在干燥综合症患者中的携带频率高于正常人群。家族聚集性： 如果家族中有亲属患有干燥综合症，那么其他家庭成员患病的几率比普通人群要高一些。不过，这并不是说有家族史就一定会发病，只是遗传因素增加了发病的可能性。
免疫因素方面
自身免疫反应异常： 人体的免疫系统会错误地攻击自身的腺体组织，尤其是唾液腺和泪腺。正常情况下，免疫系统能够识别自身和非自身物质并进行防御，但在干燥综合症患者体内，免疫系统出现紊乱，产生了多种自身抗体，如抗SSA抗体、抗SSB抗体等。这些自身抗体攻击唾液腺和泪腺的细胞，导致腺体分泌功能受损，从而出现口干、眼干等干燥综合症的典型症状。T细胞和B细胞异常： T细胞和B细胞在免疫反应中起着重要作用。在干燥综合症患者体内，T细胞的功能失调，不能正常调节B细胞的活性。B细胞则会过度活化，产生大量的自身抗体，进一步加剧了自身免疫反应对腺体的损伤。
病毒感染方面
病毒感染可能诱发： 某些病毒感染可能是诱发干燥综合症的因素之一。例如，EB病毒、丙型肝炎病毒等。有研究发现，在干燥综合症患者的唾液腺组织中可以检测到EB病毒的相关基因片段。病毒感染可能会改变人体的免疫环境，使得原本具有遗传易感性的个体更容易发生自身免疫反应，从而引发干燥综合症。不过，并不是感染了这些病毒就一定会患上干燥综合症，还需要结合其他因素共同作用。