干燥综合症是一种自身免疫性疾病，其病因目前尚未完全明确，但有多种因素可能参与其中。据研究，遗传因素在干燥综合症的发病中起到一定作用，约10%的干燥综合症患者有家族史。
遗传因素方面：
人类白细胞抗原（HLA）相关： 研究发现，某些HLA基因与干燥综合症的易感性相关。例如，HLA-DR3、HLA-DR4等基因在干燥综合症患者中的携带频率可能高于正常人群。不同种族的人群中，HLA基因与干燥综合症的关联也有所差异，但总体上遗传易感性是干燥综合症发病的一个重要基础。
免疫因素方面：
淋巴细胞异常活化： 体内的淋巴细胞会异常活化，B淋巴细胞过度增殖，产生大量自身抗体，如抗SSA抗体、抗SSB抗体等。这些自身抗体攻击自身的唾液腺、泪腺等外分泌腺体，导致腺体的分泌功能受损，出现口干、眼干等典型的干燥症状。例如，抗SSA抗体和抗SSB抗体在干燥综合症患者中的阳性率较高，它们的存在反映了免疫系统对自身腺体组织的攻击。细胞因子失衡： 体内的细胞因子网络也会发生失衡。一些促炎细胞因子的水平会升高，如肿瘤坏死因子-α（TNF-α）、干扰素-γ（IFN-γ）等，这些细胞因子会进一步加重腺体组织的炎症反应，使得腺体的损伤持续进展。而一些抗炎细胞因子的作用则相对减弱，无法有效对抗炎症，从而导致干燥综合症的病情逐渐发展。
病毒感染因素方面：
EB病毒感染： EB病毒与干燥综合症的发病可能存在关联。EB病毒是一种常见的疱疹病毒，在干燥综合症患者的唾液腺、泪腺等组织中可能检测到EB病毒的基因片段或相关抗原。EB病毒感染可能会激活人体的免疫系统，打破免疫耐受，导致自身免疫反应的发生，进而引发干燥综合症相关的腺体损伤和免疫异常。丙型肝炎病毒感染： 部分干燥综合症患者可能合并丙型肝炎病毒感染。丙型肝炎病毒感染可通过多种机制影响免疫系统，促使自身免疫反应的产生，增加干燥综合症的发病风险。例如，丙型肝炎病毒感染可能导致免疫细胞功能紊乱，促进自身抗体的产生，从而参与干燥综合症的病理过程。