干燥综合症的病因目前尚未完全明确，一般认为可能与遗传、免疫、感染等多种因素有关。据研究，遗传因素在其中起到一定作用，某些基因的遗传易感性会增加患干燥综合症的风险。
遗传因素：
基因关联： 研究发现，人类白细胞抗原（HLA）系统中的某些基因与干燥综合症的发病相关。例如，HLA - DR3、HLA - DR4等基因在干燥综合症患者中的携带频率可能高于正常人群。家族聚集性： 如果家族中有亲属患有干燥综合症，那么其他家庭成员患该病的风险可能会比普通人群高一些，但具体的遗传模式还不十分清晰，不是说家族中有患者就一定会遗传给后代，只是相对风险有所增加。
免疫因素：
自身免疫反应异常： 人体的免疫系统会错误地攻击自身的外分泌腺体，尤其是唾液腺和泪腺。正常情况下，免疫系统能够识别和抵御外来的病原体等异物，但在干燥综合症患者体内，免疫系统失调，产生了多种自身抗体，如抗SS - A抗体、抗SS - B抗体等。这些自身抗体参与了对唾液腺和泪腺等外分泌腺体的损伤过程，导致腺体分泌功能下降，从而出现口干、眼干等干燥的症状。T细胞和B细胞异常： T细胞和B细胞是免疫系统的重要组成部分，在干燥综合症患者中，T细胞和B细胞的功能也出现异常。T细胞可能会过度活化，分泌过多的细胞因子，影响B细胞的功能，使得B细胞产生大量自身抗体，进一步加重免疫损伤。
感染因素：
病毒感染： 某些病毒可能与干燥综合症的发病有关。例如，EB病毒（Epstein - Barr virus）和丙型肝炎病毒（HCV）等。有研究发现，在干燥综合症患者的唾液腺和泪腺组织中，可能检测到EB病毒的相关基因或抗原。病毒感染可能会触发人体的免疫反应，导致自身免疫性损伤的发生。不过，并不是感染了这些病毒就一定会患干燥综合症，而是在遗传易感性和免疫失调等因素的共同作用下，加上病毒感染的诱因，才可能引发疾病。