肠化生通常没有明显特异性症状，部分人可能会有消化不良相关表现，比如约半数以上患者会出现上腹部隐痛、胀满、嗳气等，进食后可能加重。
消化系统相关症状表现
上腹部不适： 不少肠化生患者会有上腹部隐痛，疼痛程度不一，有的较轻，仅感觉隐隐作痛，有的可能相对明显些。也有部分人会有上腹部胀满感，吃饭少量就觉得肚子饱胀。还有嗳气情况，时不时就会打个嗝。而且进食后，尤其是吃了较难消化的食物后，上腹部不适症状可能更易加重。消化不良表现： 会出现食欲减退的情况，对平时喜欢吃的食物兴趣降低。还可能有反酸现象，胃酸往上涌，感觉喉咙有酸酸的味道。有的患者会有烧心感，胸骨后有灼烧样感觉。另外，部分人会有恶心症状，偶尔会觉得恶心想呕吐，但真正呕吐的情况相对较少。
全身相关表现情况
体重变化： 由于消化功能受影响，长期肠化生可能会影响营养吸收，部分患者会出现体重缓慢下降情况。比如几个月下来，体重能减轻2 - 5公斤左右，但这也不是所有肠化生患者都会出现的，个体差异较大。疲劳感： 因为营养吸收不好等因素，有些患者会感觉容易疲劳，精力不如以前，稍微活动一下就觉得累，想休息。不过疲劳感也可能和其他因素有关，需要结合具体情况判断是否由肠化生导致。
与其他疾病混淆的表现提示
与胃炎症状易混淆： 肠化生引起的上腹部不适等表现和胃炎有相似之处，比如胃炎也常出现上腹部隐痛、胀满、嗳气等。所以不能仅通过症状来区分肠化生和胃炎，需要进一步做胃镜等检查来明确。与胃溃疡症状部分重叠： 胃溃疡也可能有上腹部疼痛，疼痛有一定规律性，比如餐后痛等，这和肠化生的一些表现有重叠。但胃溃疡还有其独特的特点，像疼痛更有节律性等，还是需要借助胃镜及病理检查等来精准鉴别。