结核性腹膜炎主要通过抗结核药物治疗，常用的抗结核药物有异烟肼、利福平、吡嗪酰胺、乙胺丁醇等，一般需要规范治疗6~9个月。
药物治疗要点
一线抗结核药：异烟肼是常用的抗结核药物，能抑制结核菌细胞壁的合成，起到杀菌作用；利福平可抑制结核菌RNA聚合酶，阻碍mRNA合成，达到杀菌效果。这两种药物常联合使用。二线抗结核药：如果患者对一线药物耐药或不能耐受，会考虑使用二线抗结核药，比如对氨基水杨酸异烟肼等，不过这类药物副作用相对可能多一些。
手术治疗情况
紧急手术指征：当出现急性肠穿孔，或腹腔脓肿经抗生素治疗无效时，需要进行手术治疗。一般手术情况：如果患者有不完全性、慢性肠梗阻经内科治疗无效，或与急腹症不能鉴别时，也可考虑手术，但手术并不能完全根治，术后仍需抗结核治疗。
一般治疗注意
休息与营养：患者需要充分休息，一般来说，活动量要适当减少，让身体有恢复的时间。同时要保证营养摄入，多吃富含蛋白质、维生素的食物，像鸡蛋、牛奶、新鲜蔬菜和水果等，以增强身体抵抗力，一般建议每天摄入优质蛋白质不少于1克/千克体重。对症治疗：如果患者有发热等症状，体温超过38.5℃时，可适当进行物理降温，如用温水擦拭身体等，必要时可遵医嘱使用退热药物。如果有腹痛情况，可根据疼痛程度，在医生指导下使用适当的止痛药物，但要注意避免掩盖病情。