毛囊炎的治疗药物有多种，一般局部外用药物较为常用。比如莫匹罗星软膏，它对革兰阳性球菌有很好的抗菌作用，能帮助减轻毛囊炎引起的红肿、疼痛等症状。
外用抗生素类药物
莫匹罗星软膏： 适用于革兰阳性球菌引起的皮肤感染，像金黄色葡萄球菌等导致的毛囊炎，可直接涂抹在患处，抑制细菌生长。夫西地酸乳膏： 对引起毛囊炎的常见细菌也有良好的抗菌活性，能有效缓解毛囊炎的炎症反应，使用时取适量均匀涂抹于患处。
抗真菌类药物
酮康唑乳膏： 如果是由真菌感染引起的毛囊炎，酮康唑乳膏就比较适用。它可以抑制真菌细胞膜的合成，从而发挥抗真菌作用。一般每天涂抹1 - 2次，连续使用一段时间。联苯苄唑乳膏： 同样用于治疗真菌性毛囊炎，能通过抑制真菌的麦角甾醇合成来达到杀菌效果，使用方法是外用，早晚各一次。
中药外治药物
如意金黄散： 用醋或蜂蜜调成糊状后外敷在毛囊炎患处，有清热解毒、消肿止痛的作用，对于红肿热痛明显的毛囊炎有一定疗效。鱼石脂软膏： 具有温和的刺激性，可促进局部血液循环，起到消炎、消肿、促进脓肿破溃的作用，适用于毛囊炎初期红肿疼痛的情况。毛囊炎的治疗要根据具体病因选择合适的药物。如果是细菌感染引起的，优先选用抗生素类药物；若是真菌感染导致，则抗真菌药物更合适。同时，要注意保持皮肤清洁，避免搔抓，防止感染扩散。如果毛囊炎症状较为严重，或者经过外用药物治疗效果不佳，还可能需要结合口服药物等其他治疗方法，但具体要在医生的指导下进行。