颈源性头疼的治疗方法多样，一般可通过非药物治疗和药物治疗等方式来改善。比如，约有60%的颈源性头疼患者通过规范治疗能明显缓解症状。
非药物治疗之物理治疗
颈椎牵引： 适当的颈椎牵引可以拉开椎间隙，减轻对神经的压迫，一般建议在专业医生指导下进行，牵引重量通常从3 - 5公斤开始，根据患者耐受情况调整。按摩推拿： 由专业人员进行颈部按摩推拿，能放松颈部肌肉，缓解肌肉紧张，改善局部血液循环，但要注意手法需轻柔，避免过度用力造成损伤。
非药物治疗之康复锻炼
颈部伸展运动： 每天可进行几次颈部伸展动作，比如缓慢将头部向一侧倾斜，尽量用耳朵去贴近肩膀，保持15 - 30秒，然后换另一侧，重复进行。颈部旋转运动： 缓慢地转动颈部，从左到右或从右到左，转动时要保证动作平稳，每次转动幅度不宜过大，可逐渐增加活动范围。
药物治疗
非甾体类抗炎药： 像布洛芬等非甾体类抗炎药可以缓解疼痛和炎症，这类药物能抑制体内前列腺素的合成，从而减轻头疼症状，但要注意可能会有胃肠道不适等副作用，有胃溃疡等病史的患者需谨慎使用。肌肉松弛剂： 例如乙哌立松，它可以松弛颈部紧张的肌肉，对于因肌肉紧张导致的颈源性头疼有一定的治疗作用，不过使用时要遵循医生的建议，注意药物可能带来的嗜睡等不良反应。
微创及手术治疗
微创治疗： 当保守治疗效果不佳时，可考虑微创治疗，如射频消融术，通过射频能量作用于病变的神经组织，达到缓解疼痛的目的，一般适用于经过严格保守治疗无效且符合相应指征的患者。手术治疗： 只有在病情非常严重，经多种保守及微创治疗无效，且明确有颈椎结构异常导致神经压迫等情况时，才会考虑手术治疗，手术风险相对较高，术后恢复也需要一定时间。