卵巢囊肿是否需要手术不能一概而论，一般直径小于5厘米且无明显症状的囊肿，约有1/4可能是生理性的，会在月经后自行消失，这种情况通常不需要手术。但如果囊肿直径大于5厘米，或持续存在超过3个月，就需要考虑手术。
生理性卵巢囊肿情况
滤泡囊肿： 这是最常见的生理性囊肿，多发生在排卵后，一般直径在2~5厘米左右，通常会在月经来潮后自行缩小或消失，不需要特殊处理，定期复查超声观察即可，一般观察1~2个月经周期后再复查超声。黄体囊肿： 多在怀孕早期或月经前期出现，一般直径一般小于5厘米，多数也会在月经后消失，同样定期复查超声追踪变化就行。
病理性卵巢囊肿情况
子宫内膜异位囊肿： 这类囊肿与子宫内膜异位症有关，囊肿内含有类似巧克力样的液体，直径常超过5厘米，而且会逐渐增大，还可能引起痛经、不孕等问题，一般建议手术治疗。如果患者有生育需求，医生会评估后选择合适的手术方式尽量保留生育功能；如果没有生育需求且症状明显，也可考虑手术切除。浆液性或黏液性囊腺瘤： 属于常见的卵巢良性肿瘤，一般生长较为缓慢，但随着囊肿增大，可能会出现腹胀等不适，而且存在恶变的可能，所以直径超过5厘米的浆液性或黏液性囊腺瘤通常建议手术切除，手术方式多为卵巢囊肿剥除术。
特殊情况的卵巢囊肿
绝经后女性的卵巢囊肿： 绝经后女性卵巢囊肿需要格外警惕，因为此时发生恶性肿瘤的风险增加，一旦发现卵巢囊肿，即使直径小于5厘米，也建议进一步检查评估，必要时手术切除，明确囊肿性质。合并急腹症的卵巢囊肿： 如果卵巢囊肿发生扭转、破裂等情况，会引起突然的剧烈腹痛，属于妇科急症，需要立即手术治疗，否则可能导致卵巢坏死等严重后果。