卵巢囊肿是否需要手术不能一概而论，一般直径小于5厘米且无明显症状的卵巢囊肿，约有1/4可能是生理性的，可在月经后复查，有自行消失的可能，这种情况通常不需要手术；而直径大于5厘米，或持续存在超过3个月，或怀疑为恶性的卵巢囊肿，通常需要手术治疗。
生理性卵巢囊肿的情况
滤泡囊肿： 这是最常见的生理性囊肿，多发生在排卵后，一般直径在2~5厘米左右，通常不会引起症状，多数会在月经来潮后自行消失，所以不需要手术治疗，但需要定期复查B超，观察囊肿变化情况。黄体囊肿： 黄体囊肿也属于生理性的，一般在妊娠早期或月经前出现，直径一般不超过5厘米，多数可在2~3个月内自行消退，同样不需要手术干预，定期复查监测即可。
病理性卵巢囊肿的情况
卵巢子宫内膜异位囊肿： 这种囊肿与子宫内膜异位症有关，囊肿内含有类似巧克力样的液体，直径往往超过5厘米，会引起进行性加重的痛经、不孕等症状，通常需要手术治疗，尤其是对于有生育要求或症状严重的患者。浆液性囊腺瘤或黏液性囊腺瘤： 属于常见的卵巢良性肿瘤，一般生长较缓慢，但当肿瘤直径超过5厘米时，发生破裂、扭转等并发症的风险增加，通常需要手术切除。卵巢恶性肿瘤： 如卵巢癌等，一旦怀疑或确诊为恶性卵巢肿瘤，应尽早手术，手术方式根据肿瘤分期等情况而定，可能需要进行全面的分期手术等。
特殊情况的卵巢囊肿
绝经后女性的卵巢囊肿： 绝经后女性体内雌激素水平降低，若发现卵巢囊肿，由于恶性肿瘤的可能性相对增加，所以一旦发现直径大于2~3厘米的卵巢囊肿，通常建议手术切除，以明确囊肿性质，排除恶性病变。有压迫症状的卵巢囊肿： 有些卵巢囊肿较大，会压迫周围组织，引起腹痛、尿频、便秘等症状，即使囊肿直径未达到5厘米，也可能需要手术治疗，解除压迫症状。