尿路感染反复发作可能由多种原因引起。一般来说，约50%的女性在一生中至少会发生一次尿路感染，而部分女性会出现反复发作的情况。
自身因素方面
尿路结构或功能异常： 比如存在尿路结石、先天性尿路畸形等情况。尿路结石会阻碍尿液正常排出，细菌容易在局部滋生繁殖；先天性尿路畸形使得尿液引流不畅，增加了尿路感染复发的风险。例如，有尿道狭窄问题的人，尿液排出受阻，就更容易反复发生尿路感染。机体免疫力低下： 像糖尿病患者，由于血糖控制不佳，机体抵抗力下降，白细胞的吞噬作用减弱，容易让细菌在泌尿系统滋生，从而导致尿路感染反复发作。还有长期使用免疫抑制剂的人，自身免疫功能受抑制，也容易遭遇尿路感染的反复侵扰。
卫生及生活习惯方面
个人卫生不良： 女性尿道较短且直，若不注意会阴部清洁，细菌很容易侵入尿道引发感染。比如不经常更换内裤，或者便后擦拭方向不对（应从前往后擦，若从后往前擦，就容易把肛门处的细菌带到尿道），都可能增加尿路感染复发几率。饮水过少： 每天饮水量不足，会导致尿液生成减少，尿液对尿道的冲刷作用减弱，细菌就容易在尿路停留繁殖。建议每天至少饮用1500 - 2000毫升水，以保证充足的尿量来冲刷尿道。性生活相关因素： 女性在性生活后容易发生尿路感染，这是因为性生活可能会将尿道口周围的细菌挤入尿道，尤其是有多个性伴侣或性生活不注意卫生的女性，复发风险更高。另外，绝经后的女性由于雌激素水平降低，阴道和尿道黏膜变薄，局部抵抗力下降，也更容易反复出现尿路感染。
医源性因素方面
导尿管使用： 长期留置导尿管的患者，导尿管会破坏尿道黏膜的完整性，为细菌入侵提供了通道，这类患者尿路感染反复发作的概率较高。一般来说，留置导尿管超过3天，尿路感染的发生率就会大幅增加。泌尿系统检查： 比如做膀胱镜检查等侵入性操作时，如果消毒不严格，可能会将细菌带入泌尿系统，引发感染，而且检查后如果没有做好护理，也容易导致尿路感染反复。