引发手足口病的常见病原体主要是肠道病毒，其中以肠道病毒71型（EV71）和柯萨奇病毒A组16型（CVA16）最为常见。
肠道病毒71型特点
传播途径： 肠道病毒71型可通过密切接触传播，比如接触被污染的玩具、餐具等物品后，病毒可能会通过口腔进入人体。它在托幼机构等儿童聚集场所容易传播开来。症状表现： 感染肠道病毒71型后，患儿可能会出现比较严重的症状，像高热、口腔内疱疹较多且溃疡明显，还可能出现肢体抖动、精神差等神经系统受累的表现，少数重症患儿可能发展为脑炎、脑干炎等，危及生命。
柯萨奇病毒A组16型特点
传播情况： 柯萨奇病毒A组16型也是手足口病的常见病原体，同样通过接触传播，在儿童群体中易造成局部流行。症状特点： 感染该病毒后，患儿一般以口腔和手足部位出现疱疹为主要表现，发热相对肠道病毒71型可能没那么高，整体症状相对没那么严重，但也需要关注病情变化，个别患儿也可能出现并发症。
其他相关肠道病毒
其他肠道病毒： 除了上述两种常见病毒外，还有柯萨奇病毒A组的其他亚型以及肠道病毒的其他型别也可能引发手足口病。比如柯萨奇病毒A组的其他一些型别，也能导致患儿出现手足口病的相关症状，只是相对来说发病率和严重程度稍低一些，但同样需要重视。这些病毒引起的手足口病症状也有相似之处，主要还是以手、足、口腔等部位的皮疹、疱疹和发热为主要临床表现。