双侧附睾头囊肿是否影响生育，需分情况来看。一般较小的双侧附睾头囊肿通常不会影响生育，而较大的囊肿可能会对生育有一定影响，比如当囊肿较大时可能压迫附睾管，影响精子的输送等。
囊肿大小与生育的关系
较小囊肿情况：如果双侧附睾头囊肿直径在1厘米以内，这种情况下对生育功能影响相对较小。因为囊肿较小，一般不会明显阻碍精子的正常运输和储存等过程，对生育的干扰不大。较大囊肿情况：当双侧附睾头囊肿直径超过2厘米时，就有可能对生育产生较为明显的影响。较大的囊肿会占据附睾内的空间，可能压迫附睾管，导致精子排出受阻，进而影响精子的正常输出，降低生育的概率。
囊肿是否合并其他病变
单纯囊肿无其他病变：如果双侧附睾头囊肿是单纯性的，没有合并附睾炎等其他病变，那么对生育的影响相对有限。但仍需要定期监测囊肿的变化情况。合并附睾炎等病变：若双侧附睾头囊肿合并有附睾炎，炎症会影响附睾的正常功能，不仅会影响精子的生成环境，还可能导致精子质量下降等问题，从而明显影响生育。此时需要积极治疗附睾炎等相关病变，以改善生育状况。
囊肿的发展速度
发展缓慢的囊肿：如果双侧附睾头囊肿生长非常缓慢，数年甚至十几年都没有明显变化，那么对生育的影响通常较小。因为附睾有一定的代偿能力，缓慢生长的囊肿可能还不至于严重影响精子的运输和储存等功能。发展迅速的囊肿：要是双侧附睾头囊肿在短时间内（如半年内）明显增大，这种情况下就需要引起重视，因为快速增大的囊肿很可能会对附睾的结构和功能造成较严重的破坏，进而影响生育，需要及时就医评估是否需要治疗。