双侧附睾囊肿不一定都会影响生育，一般较小的双侧附睾囊肿对生育影响不大，但较大的双侧附睾囊肿可能会有一定影响。据临床研究，约有10% - 15%的双侧附睾囊肿患者可能出现生育相关问题。
囊肿大小与生育的关系
较小囊肿影响小：当双侧附睾囊肿直径小于1厘米时，通常对附睾的生精功能和输精功能影响较小，一般不会明显影响生育。因为此时囊肿体积小，没有压迫到附睾内的生精小管和输精管道，精子的生成、运输等过程基本不受干扰。较大囊肿有影响：如果双侧附睾囊肿直径大于2厘米，就可能会压迫附睾内的生精小管，影响精子的生成和成熟，还可能阻碍精子的运输，从而降低生育的概率。这是因为较大的囊肿会占据附睾内的空间，干扰精子正常的发育环境和运输通道。
囊肿位置与生育的关联
附睾头部囊肿：附睾头部的囊肿相对来说对生育的影响可能相对小一些。因为附睾头部主要是精子进入附睾后的初始储存部位，其囊肿如果不是特别大，对精子初始的储存功能影响有限。但如果囊肿持续增大，也可能会逐渐影响精子的后续运输等环节。附睾体尾部囊肿：附睾体尾部的囊肿对生育的影响相对较大。由于附睾体尾部是精子进一步成熟和运输的重要区域，囊肿如果生长在这个部位，很容易压迫到正在成熟的精子以及影响精子向输精管的输送，进而明显影响生育能力。
囊肿成因与生育的关系
炎症引起的囊肿：如果双侧附睾囊肿是由附睾炎等炎症引起的，炎症可能会同时影响附睾的生精功能和输精功能。炎症会导致局部组织水肿、细胞受损等，不仅会影响精子的生成，还会使输精管道的通畅性受到破坏，从而大大增加生育困难的风险。据统计，因炎症导致的双侧附睾囊肿患者中，约30% - 40%存在生育问题。先天性囊肿：先天性的双侧附睾囊肿相对来说，如果囊肿结构没有严重破坏附睾的正常生理功能，对生育的影响可能相对局限。但如果先天性囊肿同时合并有附睾其他结构的异常，也可能会影响生育。比如先天性囊肿合并附睾管发育畸形等情况，就会明显干扰精子的正常发育和运输，导致生育受到影响。