多囊卵巢综合征的病因目前尚未完全明确，但研究发现可能与以下因素有关。一般认为，遗传因素在其中起到一定作用，据统计，约60% - 70%的患者存在遗传易感性，也就是说如果家族中有亲属患有多囊卵巢综合征，那么自身患病风险会相对增高。
遗传因素方面
家族遗传倾向： 多囊卵巢综合征具有一定的家族聚集性，如果母亲患有多囊卵巢综合征，其女儿患病的概率比正常人群要高。比如有家族史的女性，发病风险比无家族史的女性高出2 - 3倍左右。基因遗传： 目前已经发现一些与多囊卵巢综合征相关的基因位点，这些基因可能影响激素的分泌、代谢等过程，从而增加患病风险。
内分泌失调方面
下丘脑 - 垂体 - 卵巢轴调节功能异常： 下丘脑分泌的促性腺激素释放激素节律紊乱，会使垂体分泌的促黄体生成素（LH）升高，促卵泡生成素（FSH）降低，LH/FSH比值大于2 - 3。这种失衡会影响卵巢的正常排卵功能，导致卵泡发育异常，不能正常排卵。胰岛素抵抗与高胰岛素血症： 约50% - 70%的多囊卵巢综合征患者存在胰岛素抵抗。胰岛素抵抗会使身体对胰岛素的敏感性下降，胰腺为了维持正常血糖水平，会分泌更多胰岛素，形成高胰岛素血症。高胰岛素血症又会刺激卵巢分泌过多雄激素，进一步加重多囊卵巢的症状。
生活方式因素方面
饮食不规律： 长期高热量、高脂肪、高糖的饮食，会导致体重增加，而肥胖是多囊卵巢综合征的一个重要诱因。例如，每天摄入过多油炸食品、甜食等，会使身体代谢紊乱，增加患病风险。缺乏运动： 运动量过少的人群，身体代谢减慢，也容易出现内分泌失调，增加多囊卵巢综合征的发病几率。研究表明，每周运动时间少于2小时的人群，患病风险比运动充足的人群要高。长期精神压力大： 长期处于高压力状态下，会影响下丘脑 - 垂体 - 卵巢轴的功能，导致激素分泌紊乱，从而引发多囊卵巢综合征。比如一些工作压力大的职场女性，患病风险相对较高。