睡醒眼睛干涩疼痛的原因可能包括睡眠质量不佳、结膜炎、角膜炎等。具体如下：
一、睡眠质量不佳：如果患者夜间睡眠质量差，比如睡眠时间短，或者有失眠情况，眼睛没能得到充分休息，那么睡醒后就容易出现眼睛干涩、疼痛等症状。对此，患者早上可进行局部冷敷，日常多补充富含维生素A的食物，这样有助于缓解症状。
二、结膜炎：当结膜组织出现炎症性病变时，睡醒后可能会有眼部发痒、烧灼、干涩等状况。此时患者可在医生指导下使用诸如氯霉素滴眼液、更昔洛韦滴眼液等药物进行治疗。
三、角膜炎：若角膜受到微生物感染而引发炎症，导致角膜表面不光滑，就会引起眼睛干涩、疼痛、视物模糊等表现，且在夜间和睡醒后症状更为明显。患者可在医生的指导下使用妥布霉素滴眼液、那他霉素滴眼液等药物进行治疗。
此外，还可能是干眼症导致的。如果有强烈不适感，建议及时前往医院诊治。在治疗期间，饮食应清淡，避免食用辛辣油腻食物，保证充足睡眠，保持心情愉悦。
总之，当睡醒后出现眼睛干涩疼痛时，要及时查找原因，根据具体情况进行相应的处理和治疗。