小腹肚子疼一阵一阵的可能由多种原因引起。比如女性生理期时，部分女性在月经来潮前1-2天会出现小腹阵痛，一般持续1-2天左右，随着月经来潮，疼痛可能会缓解。
一、妇科方面的原因
1. 痛经：女性在月经期间，子宫内膜前列腺素含量增高，可引起子宫平滑肌过强收缩、血管痉挛，造成子宫缺血、缺氧状态而出现痛经，表现为小腹一阵一阵的疼痛，疼痛程度因人而异，有的可能较轻，仅感觉坠胀不适，有的则较为剧烈，可能伴有恶心、呕吐等症状。2. 盆腔炎：盆腔内存在炎症时，炎症刺激会导致小腹疼痛，疼痛多为持续性，在活动或性交后可能加重，也会出现一阵一阵的疼痛情况。患者还可能伴有阴道分泌物增多、发热等症状，一般病程较长，若不及时治疗可能会反复发作。
二、肠道方面的原因
1. 肠易激综合征：这是一种常见的功能性肠病，病因尚不明确，可能与胃肠动力异常、内脏高敏感性、肠道感染后、精神心理障碍等因素有关。患者会出现小腹一阵一阵的疼痛，疼痛部位多在下腹，排便或排气后疼痛可能会缓解，同时还常伴有排便习惯改变，如腹泻或便秘，或腹泻与便秘交替出现。2. 肠炎：如果吃了不洁食物等，可能引发肠炎，炎症刺激肠道黏膜，导致肠道痉挛，出现小腹一阵一阵的疼痛，同时可能伴有腹泻、恶心、呕吐等症状。例如细菌性肠炎，多是由于食用被细菌污染的食物引起，患者除了小腹阵痛外，大便可能会呈黏液脓血便等。
三、泌尿系统方面的原因
1. 输尿管结石：当输尿管内有结石时，结石会刺激输尿管黏膜，引起输尿管痉挛，从而出现小腹一阵一阵的绞痛，疼痛较为剧烈，还可能向会阴部放射，患者同时可能伴有血尿、尿频、尿急等症状。比如较小的结石在输尿管内移动时，就容易引发这种阵发性的疼痛。2. 膀胱炎：膀胱发生炎症时，膀胱黏膜受到刺激，也会出现小腹疼痛，疼痛可为一阵一阵的，同时患者可能有尿频、尿急、尿痛等膀胱刺激症状，严重时可能出现血尿。膀胱炎多由细菌感染引起，尤其是大肠杆菌等。