肠胃功能紊乱可以使用调节胃肠动力的药物、益生菌类药物等，比如多潘立酮一般能在一定程度上改善胃肠动力，缓解相关不适。
调节胃肠动力的药物
多潘立酮： 属于外周多巴胺受体拮抗剂，能直接作用于胃肠壁，可增加食管下部括约肌张力，防止胃-食管反流，增强胃蠕动，促进胃排空，协调胃与十二指肠运动，从而缓解肠胃功能紊乱引起的腹胀、早饱、恶心、呕吐等症状。一般适用于成人因胃肠功能紊乱出现上述症状的情况，但儿童使用需谨慎，需在医生指导下根据体重等情况衡量是否可用。莫沙必利： 是选择性5-羟色胺4（5-HT4）受体激动剂，能促进乙酰胆碱的释放，增强胃肠道运动，改善功能性消化不良等引起的肠胃功能紊乱相关症状。它对成人肠胃功能紊乱导致的消化不良、腹胀、腹痛等有一定缓解作用，老年人使用时需注意观察不良反应，必要时调整用药。
益生菌类药物
双歧杆菌四联活菌片： 含有双歧杆菌、嗜酸乳杆菌、粪肠球菌、蜡样芽孢杆菌等有益菌，这些有益菌可直接补充人体正常生理细菌，调整肠道菌群平衡，抑制肠道中对人体具有潜在危害的菌类甚至病原菌。适用于因肠道菌群失调引起的肠胃功能紊乱，比如腹泻、便秘、腹胀等情况，儿童可以使用，但需注意储存条件，要在2-8℃冷藏保存。枯草杆菌二联活菌颗粒： 含有枯草杆菌和肠球菌，可直接补充正常生理菌丛，抑制致病菌，促进营养物质的消化、吸收，抑制肠源性毒素的产生和吸收，达到调整肠道内菌群失调的目的。常用于儿童肠胃功能紊乱，像小儿腹泻、便秘、腹胀、消化不良等情况，服用时可用低于40℃的温水或牛奶冲服，也可直接服用。
抑制胃酸分泌的药物
奥美拉唑： 属于质子泵抑制剂，通过抑制胃壁细胞上的质子泵，减少胃酸分泌。对于肠胃功能紊乱中伴有胃酸过多引起的烧心、反酸等症状有缓解作用。成人可以使用，但老年人使用时要注意监测，比如长期使用可能需要关注骨密度等情况，孕妇和哺乳期妇女慎用。兰索拉唑： 也是质子泵抑制剂，作用机制与奥美拉唑类似，能抑制胃酸分泌，可用于缓解肠胃功能紊乱导致的因胃酸过多引发的相关不适，如胃痛、反酸等，成人适用，儿童用药需遵医嘱，肝肾功能不全者可能需要调整剂量。