治疗牙龈萎缩的方法需根据不同病因来定。一般来说，牙龈萎缩的治疗首先要明确病因，然后针对性处理。比如因牙周炎导致的牙龈萎缩，治疗方式就和单纯刷牙不当导致的有所不同。
牙周炎引发的牙龈萎缩治疗
基础治疗： 首先要进行牙周洁治，也就是常说的洗牙，通过洗牙可以清除牙齿表面的牙菌斑、牙结石等刺激物，一般建议每年至少进行1 - 2次洗牙来维护口腔健康。深层治疗： 如果牙周炎比较严重，可能还需要进行牙周刮治，刮治能深入牙周袋内，清除牙周袋内的菌斑、牙石以及炎性肉芽组织等，帮助牙周组织恢复健康，控制牙龈萎缩进一步发展。
刷牙不当导致的牙龈萎缩治疗
改变刷牙方式： 要摒弃错误的刷牙方法，比如横刷法，改为正确的巴氏刷牙法。巴氏刷牙法要求将牙刷与牙长轴呈45°角指向根尖方向，按照牙龈 - 牙交界区，使刷毛一部分进入龈沟，一部分铺于龈缘上，然后轻度加压，使刷毛在原位进行前后方向短距离的水平颤动，每次颤动4 - 5次，颤动时牙刷移动约1mm，每次只刷2 - 3颗牙齿，然后将牙刷移至下一组牙齿，重复同样的动作。选择合适牙刷： 应选用软毛牙刷，软毛牙刷对牙龈的刺激较小，更有利于保护牙龈健康，防止牙龈萎缩进一步加重。
不良修复体引起的牙龈萎缩治疗
更换修复体： 如果是因为不合适的假牙等不良修复体导致的牙龈萎缩，首先要及时就诊，让医生评估修复体情况，然后更换合适的修复体。合适的修复体不会对牙龈造成压迫等不良刺激，从而有助于牙龈萎缩的改善。比如原来的假牙边缘不合适，压迫牙龈，就需要重新制作合适边缘的假牙。
全身性疾病相关的牙龈萎缩治疗
控制全身性疾病： 某些全身性疾病也可能导致牙龈萎缩，比如糖尿病。如果是糖尿病患者出现牙龈萎缩，首先要积极控制血糖，将血糖控制在合理范围内，一般空腹血糖应控制在7mmol/L左右，餐后血糖控制在10mmol/L左右等。血糖得到控制后，牙龈萎缩的进展可能会减缓。同时，在控制血糖的基础上，按照上述针对牙周炎等病因的常规治疗方法进行口腔局部的处理，双管齐下促进牙龈健康的恢复。