眼睛一大一小可能由多种原因引起。一般来说，先天性因素较为常见，比如有些人天生就存在眼外肌发育不对称等情况，导致双眼大小有差异，这种差异可能从出生时就存在。
先天性因素
遗传因素： 如果家族中有眼睛大小不同的遗传倾向，那么后代出现眼睛一大一小的概率会相对增加。这种遗传可能是由于基因决定了眼部组织的发育差异。眼外肌发育异常： 胎儿在发育过程中，眼外肌发育不均衡，会使得眼球的位置和运动出现差异，进而表现为眼睛一大一小。这种情况往往在出生时就可发现。
后天性因素
眼部疾病： 眼部的一些疾病也可能导致眼睛一大一小。例如，上睑下垂，这是一种常见的眼部疾病，由于提上睑肌功能不全或丧失，导致上睑部分或全部下垂，使患侧眼睛看起来比正常眼睛小。还有眼眶的病变，如眼眶骨折、眼眶内长肿瘤等，会改变眼眶的结构和眼球的位置，从而造成双眼大小不一。一般来说，眼眶肿瘤如果是良性的，生长缓慢时可能在数月甚至数年才会出现明显的眼睛大小变化；如果是恶性肿瘤，可能进展较快。外伤： 眼部受到外伤后，可能会引起眼部组织的损伤和变形。比如眼部遭受撞击后，眼眶骨折、眼外肌损伤等，都可能导致眼睛一大一小。例如，严重的眼部外伤后1 - 2周内可能就会发现眼睛大小有明显变化。
神经系统问题
面神经麻痹： 面神经麻痹会影响眼部肌肉的运动，导致患侧眼睑闭合不全或眼部肌肉运动异常，进而使眼睛看起来一大一小。面神经麻痹如果是贝尔麻痹，通常在发病后数天到数周内逐渐出现眼部的异常表现，比如患侧眼睛不能正常闭合，与另一侧眼睛对比就会显得小一些。