肩胛骨缝长期疼可能由以下原因引起。
1.肩部肌肉劳损：长期过度使用肩部肌肉，或保持不良姿势，可导致肌肉疲劳和损伤，引起疼痛。
2.肩周炎：肩周炎又称五十肩，是以肩关节疼痛和活动不便为主要症状的常见病症。其主要表现为肩部逐渐产生疼痛，夜间为甚，逐渐加重，肩关节活动功能受限而且日益加重，达到某种程度后逐渐缓解，直至最后完全复原，大概会持续一年时间。
3.颈椎病：当颈椎发生病变时，可能压迫神经，引起肩部放射性疼痛。
4.心脏疾病：部分心脏疾病也可能引起肩部疼痛，如心肌梗死、心绞痛等。
5.其他：胸廓出口综合征、肩部外伤、肩部肿瘤等也可能导致肩胛骨缝疼。
如果疼痛持续时间较长或伴有其他症状，如手臂麻木、无力、呼吸困难等，建议及时就医，进行详细的检查，以明确病因，并采取相应的治疗措施。同时，在日常生活中，应注意保持正确的姿势，避免过度劳累和长时间保持同一姿势，适当进行肩部运动和按摩，也有助于缓解疼痛。