肩胛骨缝长期疼可能由以下原因引起。
1.肩周炎：
肩周炎又称肩关节周围炎，是以肩关节疼痛和活动不便为主要症状的常见病症。其主要表现为肩部逐渐产生疼痛，夜间为甚，逐渐加重，肩关节活动功能受限而且日益加重，达到某种程度后逐渐缓解，直至最后完全复原，大概有1%～5%的患者可能遗留有不同程度的功能障碍。
2.肩袖损伤：
肩袖损伤多因间接暴力所致，好发于40岁以上患者，如提物、投掷或肩部牵拉后，逐渐出现肩部疼痛，夜间痛甚，影响睡眠，肩关节活动时疼痛加剧，严重者有肌肉萎缩及肩关节活动受限。
3.颈椎病：
颈椎病可引起颈肩部疼痛，若疼痛向上肢放射，还可能伴有上肢麻木、无力等症状。
4.心脏疾病：
部分心脏疾病也可引起肩部疼痛，如心肌梗死、心绞痛等，疼痛可向左肩部放射。
5.其他：
肺部疾病、肩部肿瘤等也可引起肩胛骨缝疼痛。
如果出现肩胛骨缝长期疼的症状，建议及时就医，明确病因，以便进行针对性治疗。